研究院将鼓励创新、尊重知识、尊重人才、保护知识产权、捍卫科学尊严作为首要任务，尤其重视鼓励原始创新、源头创新和知识产权的保护。参照主管部门和学校的相应政策，结合相关学科实际情况，制定一系列开放、优惠、激励政策，建立知识、资本、劳动等要素按贡献参与分配的机制。要明确科技奖励政策，兼顾创新水平和应用价值、从“顶天立地”两个角度进行激励引导，鼓励人员产生重大、原始创新成果。尤其将提倡奖励科研团队的方式，努力激发成员的主动积极性和钻研投入精神。
通过激励机制进行引导，将专利的申请和成果转化纳入到工作计划以及绩效考核的范畴中，着重改善一般科研单位中普遍存在的重论文轻专利、重成果轻转化的问题。与此同时，专门设立“技术转移服务部”，安排专人从事知识产权保护与专利申请工作，通过制度规范以避免科研成果的侵权与被侵权以及可能产生的科研纠纷，形成一套科学、合理、成熟的国际化发展运行模式，为配合江苏省高瞻远瞩的“深入实施知识产权战略”，打造研究院知识产权品牌付出努力，争取在生物电子、先进能源、信息材料、有机电子、纳米科学、生命影像、微纳机电、有机显示等方向取得重大创新突破，推动科技成果、知识产权与商业推广的快速完美对接。